Технология 10х

Представляем уникальную новую услугу — секвенирование 10x с использованием технологий Chromium и GemCode от 10x Genomics.
В основе метода лежит использование микрореакторов: отдельные клетки или образцы ДНК (от 1 нг) заключаются в гелевые капли и готовятся независимо друг от друга. Каждой капле назначается индивидуальная молекулярная метка, с помощью которой можно отличить образцы на стадии анализа данных.

Применение

• Анализ экспрессии отдельных клеток Индивидуальный профиль экспрессии до 80 000 клеток, точность метода позволяет идентифицировать редкие подтипы внутри тканей.
• Иммунное профилирование Каталогизация V(D)J-репертуара, полноразмерный анализ тяжёлых и лёгких цепей иммуноглобулинов, выделение изотипов, оценка разнообразия и клональности клеток.
• Сборка de novo Эффективная и малозатратная реконструкция генома благодаря локусной группировке чтений.
• Экзомное и полногеномное секвенирование Покрытие ранее недоступных участков благодаря особой обработке паралогов, псевдогенов и дупликаций, определение крупных перестроек, копийности и склеек генов, фазирование аллелей для выявления компаунд-гетерозигот.
• Массовый анализ копийности Поиск участков копийности размером от 2 Mb в тысячах отдельных клеток, кластеризация и реконструкция эволюции копийных вариантов внутри ткани, популяции стволовых клеток или опухоли.