30.04.2020

Первые результаты совместного проекта с ФНЦИРИП им. Чумакова и НИЦ КИ

Прочитаны первые геномы коронавируса пациентов из ГКБ №40 в Коммунарке — первые результаты совместного проекта ФНЦИР иммунобиологических препаратов им. М. П. Чумакова, НИЦ Курчатовский институт и ЗАО «Геноаналитика». Генетический анализ относит исследованные образцы к «европейской» эволюционной ветви. Предполагается, что в одном случае вирус был завезён в Москву из Португалии, а в другом — из Великобритании.

Айдар Ишмухаметов, генеральный директор Федерального научного центра исследований и разработки иммунобиологических препаратов им. М. П. Чумакова поясняет: «Работа по получению РНК вируса была весьма сложной и кропотливой. Более того, манипуляции с биологическими жидкостями зараженных ещё и несли определённый риск для сотрудников Любови Козловской, под чьим непосредственным руководством выполнялись эти задачи. Мы удовлетворены результатами секвенирования, которые указывают и на правильность подобранных нами методик выделения вирусной РНК. Теперь нам предстоит работа по анализу найденных генетических особенностей.»

«Из тех образцов РНК, которые мы получили от наших коллег из центра имени Чумакова, нами были приготовлены библиотеки для массового параллельного секвенирования, — говорит директор по науке ЗАО «Геноаналитика» Александр Мазур. Нам удалось секвенировать геном коронавируса с глубиной более 1000×, что позволило провести de novo сборку и обнаружить генетические особенности этих двух изолятов.»

В планах исследователей секвенирование еще не менее 96 образцов индивидуальных вирусов, и переход к созданию российской базы генетических данных SARS-Cov-2 на основе консолидации результатов работы всех отечественных исследователей, занимающихся расшифровкой генома коронавируса.
К участию в проекте приглашаются все профильные больницы и институты.
Подробнее: chumakovs.ru и genoanalytica.ru/projects/coronavirus-sequencing.